A raíz de la desgracia, camiseta del paris saint germain todos los clubes del fútbol mexicano se solidarizaron con el Monterrey y le cedieron jugadores sin cobrar por la transferencia. En mayo de 2004, los aficionados recaudaron suficiente dinero para asegurar la licencia del club para el fútbol de cuarta división a través de una campaña llamada «Bleed for Union» (en español, camiseta portugal cr7 «Sangre para Unión»). Casi un mes después, la noche del 14 de septiembre de 1945, el equipo viajaba con destino a la ciudad de Guadalajara pues en la cuarta jornada disputaría un partido contra el Oro. Como medida de prudencia, los dirigentes decidieron que no jugara el segundo partido ante una nueva Hungría, la cual tenía a un grandioso Flórián Albert. En 1992, la entidad pasó a convertirse en una sociedad anónima deportiva tras la entrada en vigor de la ley que las regulaba, y por tanto se modificó el sistema de elección de presidente, pasando de ser elegido por los socios del club, a ser elegido por los accionistas de la sociedad. El gol del triunfo y primero de toda la historia del Monterrey lo anotó el hispano-argentino José «Che» Gómez. El debut del equipo ocurrió con triunfo de 1-0 sobre los Santos del San Sebastián, de León, Guanajuato en el parque Cuauhtémoc de béisbol.
El largo máximo del campo deberá ser de 200 yardas, la anchura máxima deberá ser de 100 yardas, el largo y el ancho deberán estar delimitados con banderas; y la meta será definida por dos postes verticales, separados por ocho yardas, sin ninguna cinta o barra entre ellos. Finalmente con el paso de los años el nombre regresaría a ser Club de Fútbol Monterrey manteniendo su identidad como asociación civil. A pesar del buen gesto, el Monterrey nunca pudo recuperarse anímicamente de aquella desgracia, además de ser agobiado por los problemas económicos, finalizó el torneo como el cuadro más goleado y en el último lugar general por lo que pidió su retiro voluntario de la liga el 23 de junio de 1946, mismo día que disputó su último partido de la temporada perdiendo de local ante el Atlas. En esos partidos, Inglaterra saldría invicta, y su primer partido finalizaría con un empate a un gol, y fue jugado el 5 de marzo de 1870 en Londres, en el estadio The Oval, donde los ingleses llevaban gorras de cricket y los escoceses capuchas, estilismo que originó que la palabra cap (gorra en español), se use en inglés para designar cualquier aparición internacional.
El partido de ida se jugó el domingo 13 de agosto a las 22 en el Camp Nou de Barcelona, y el partido de vuelta el miércoles 16 de agosto a las 23 en el Santiago Bernabéu de Madrid. El campeonato nacional de 1996, tuvo por campeón a Colo-Colo, que se adjudicó su vigésimo trofeo de Primera División, teniendo al paraguayo Gustavo Benítez como entrenador y contando con jugadores como Ivo Basay, Fernando Vergara, José Luis Sierra, Marcelo Ramírez, Claudio Arbiza, Pedro Reyes, Juan Carlos González, Francisco Rojas, Fabián Guevara, Emerson Pereira, Mario Salas, Marcelo Espina, Marcelo Barticciotto y Héctor Tapia, superando a la Universidad Católica (que fue su más cercano escolta y que días después, ganó la Liguilla de Copa Libertadores), Cobreloa, Audax Italiano (equipo que ya estaba de vuelta en la categoría, en compañía de Santiago Wanderers) y Universidad de Chile, en la tabla de posiciones. La competición se jugó bajo el sistema de todos contra todos y en dos ruedas de nueve fechas, camisetas del manchester united resultando campeón aquel equipo que acumulase más puntos en la tabla de posiciones.
Sin embargo, en 1952 ya bajo el mando del presidente de la Asociación de Fútbol del estado de Nuevo León, Carlos Canseco, el mismo equipo pero reforzado fue aceptado oficialmente para ingresar a la recién organizada segunda división, no sin antes tener que librar un par de obstáculos más. En una época en la cual aún se mantenía latente la Segunda Guerra Mundial, el entonces presidente de la Asociación de Fútbol del estado de Nuevo León, Ángel F. Escobedo, logró llevar a la ciudad de Monterrey la celebración del Campeonato Nacional de Fútbol Amateur. Fue así como el 24 de abril de 1945, Ángel F. Escobedo anunció la creación del primer club regiomontano de fútbol organizado, así como su ingreso a la Liga Mayor para la temporada 1945-46. El novel equipo fue formado en su base por jugadores que se coronaron con Nuevo León, tales como Avilán, Bladé, Buanabad, Lizano, Maciel, Rivas, Rivera, y Robles, dirigidos por el también campeón estatal Manuel Galán, además de designar al mismo Estadio Cuauhtémoc y Famosa como su sede para jugar sus partidos de local. La primera directiva del Club de Fútbol Monterrey estuvo conformada por Enrique Ayala Medina como presidente, Paul C. Probert como vicepresidente, Ángel F. Escobedo como secretario, Ramón Cárdenas Coronado como tesorero, José Fidalgo Carrera, Ing.